安徽大学与合肥工业大学都是安徽省的重点高校，均被列为国家211工程大学。在本地，两校的声誉都不错。不过，两校的学科结构有所不同，合肥工业大学以工科为主，而安徽大学则更偏重于文理科，涵盖了更多的基础学科。

从就业角度看，工科专业的毕业生往往比文理基础学科的学生更具优势。这主要是因为工科专业与市场需求更为契合，且就业前景更为广阔。因此，对于希望从事工程技术领域工作的学生来说，合肥工业大学可能是一个更好的选择。

而安徽大学则提供了更为全面的教育，涵盖文理科多个领域，这对于希望在学术研究或教育领域发展的学生来说，可能更有利。此外，安徽大学在人文社科领域的研究实力较强，为学生提供了更广泛的学习和发展空间。

总之，选择哪所学校，关键在于个人的兴趣和职业规划。如果对工科感兴趣，且希望从事工程技术领域的工作，合肥工业大学可能更适合；如果希望在文理科领域深造，或者倾向于学术研究，安徽大学则是一个不错的选择。