安徽中医药大学涵盖多个学院，包括研究生院、中医学院、针灸推拿学院（康复医学院）、中西医结合学院（生命科学学院）、药学院、医药信息工程学院（网络信息中心）、医药经济管理学院、护理学院、马克思主义学院、体育健康学院、人文与国际教育交流学院（外事办、港澳台办）、继续教育学院（成人教育学院）、创新创业学院、新安书院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院。

安徽中医药大学位于安徽省合肥市，是安徽省高等教育振兴计划“地方特色高水平大学建设”高校、安徽省高峰学科建设计划支持高校，并入选中西部高校基础能力（二期）建设项目。大学始于1959年，前身是1952年成立的安徽省中医进修班。1959年，安徽省政府正式批准成立安徽中医学院。1970年，安徽中医学院并入安徽医学院。1975年，国家教育部批准恢复安徽中医学院。2000年，安徽省医药学校并入安徽中医学院。2011年，省政府批准在安徽中医学院的基础上组建成立安徽省中医药科学院。2013年，教育部同意安徽中医学院更名为安徽中医药大学。