通常内囊位于尾状核、豆状核和丘脑之间，其外侧是豆状核、内侧是丘脑、前内侧是尾状核。

内囊主要有白质纤维束的走形而形成，它分为前肢、后肢和膝部。内囊的前肢包括往上走的上行纤维，主要是丘脑和额叶之间的联系纤维。往下走的下行纤维是从额叶，一直到脑干的额叶脑桥束。内囊膝部是在V字形的间断部位，从皮层到脑干的神经核团，也叫皮质脑干束，就是从这个部位通过。内囊后肢在丘脑和豆状核之间，它的前面有从皮层到脊髓的运动神经元的皮质脊髓束通过，最后还放射到听觉皮层、视觉皮层的听辐射和视辐射。

患者应注意，内囊处非常容易出血，最常见的原因是高血压病，有豆纹动脉从这里呈直角发出，是高血压性脑出血最常见的部位。患者平时应积极控制高血压，避免情绪激动。