命题方式不同，难度不同，院校不同等。

命题方式不同：考研统考一般是由国家统一命题，统一组织时间进行考试，并且统一划定具体的分数线；自主命题是由报考院校自己出题，然后自主录取研究生。

难度不同：统考的难度一般比自主命题的难度要低，考研统考的成绩一般比较高，进行调剂也比较容易；自主命题的题目稍微难一些，所以分数较低，进行调剂时也有一定的影响。

院校不同：考研统考使用的是国家统一命题的试卷，这一类学校大部分都是普通高校；而自主命题的学校大多数是比较有名的高校。