在职学历档案存档有以下方法：学历证书和成绩单的复印件、建立档案、归档和整理、文件保护和安全、更新和维护、数字化存档。

1、学历证书和成绩单的复印件：员工应将学历证书和成绩单进行复印，并确保复印件的清晰度和完整性。

2、建立档案：在公司或组织的人力资源部门或档案管理部门，建立一个专门的学历档案。可以使用文件夹、文件柜或电子档案系统来组织和存储档案。

3、归档和整理：将员工的学历证书和成绩单复印件按照一定的分类和顺序整理，例如按照员工姓名、入职日期或学历类型等进行归档。

4、文件保护和安全：确保学历档案的保密性和安全性。只有授权人员才能访问和处理学历档案，以防止信息泄露和滥用。

5、更新和维护：定期更新员工的学历档案，包括添加新的学历信息、培训证书等。同时，确保档案的完整性和准确性。

6、数字化存档：考虑将学历档案进行数字化存档，使用电子档案管理系统或云存储服务。这样可以节省物理空间，并提高档案的可访问性和便捷性。