神木县民政局设有多个职能机构，以确保日常工作的高效运行。

首先，办公室承担着核心的行政管理工作，包括处理局机关的政务事务，协助领导处理日常事务，参与综合性文件起草，负责民政会议的组织和文秘工作。此外，办公室还负责文秘、信息、保密、档案、信访保卫、机关办公自动化，以及行政后勤和干部管理，包括考勤、考核、奖惩和离退休人员的管理工作。财务计划和统计事务也由办公室负责，确保经费的合理使用和民政数据的准确记录。

其次，双拥、优抚安置办公室专司优抚对象的抚恤、优待及军人伤亡抚恤，确保相关政策的执行和资金的发放。他们制定实施办法，指导烈士陵园管理，负责退役士兵的接收安置和就业支持工作。

最后，区划勘界、区划地名办公室负责全县行政区划的变更和管理，包括审核、上报边界调整、命名和政府驻地迁移等事宜。他们处理边界争议，规范地名标志，进行县镇际边界勘界，并管理相关的档案资料。