吉林大学珠海学院与本部吉林大学在地理位置上有着明显的区别，前者位于珠海，而后者坐落在长春。吉林大学珠海学院是在珠海设立的一所独立学院，由吉林大学申请，并经国家教育部批准设立。虽然这所学院挂名吉林大学，但实际上是独立运营的。

吉林大学珠海学院与吉林大学在许多方面存在差异。首先，学位证书的发放主体不同。在过去，无论是毕业证书还是学士学位证书，都统一标注为吉林大学。然而，现在的情况有所变化，吉林大学珠海学院的毕业证书和学士学位证书上均标注为吉林大学珠海学院，以明确其独立性。

吉林大学珠海学院与本部之间的关系相对独立，尽管吉林大学会提供一定的师资和技术支持，但这所学院在管理、教学资源分配等方面拥有更大的自主权。这种模式有助于学院更好地适应当地教育需求，同时也能为学生提供更加多元化的教育资源。

尽管吉林大学珠海学院与吉林大学在名称上保持着一定的关联，但两者的实际运作方式和资源分配有所不同。这种差异性为学生提供了更多选择，同时也促进了教育体系的多元化发展。