跨行做会计分录的原因主要是为了实现不同银行间的资金清算，确保企业财务的准确记录和流畅运作。

详细解释如下：

实现不同银行间的资金清算

在现代企业经营中，往往涉及多家银行的账户使用，如基本存款账户、一般存款账户等，用于不同的资金往来需求。当企业发生跨行交易时，比如从一家银行的账户转到另一家银行的账户，为了准确记录这笔交易，需要在会计上做出分录，以体现资金的跨行转移，保证资金流的清晰和可追溯。

确保企业财务的准确记录

会计分录是会计工作的基础，无论是本行还是跨行交易，都需要进行准确的记录。跨行交易如果得不到正确的会计分录处理，可能会导致企业账务的混乱，影响企业的财务决策和经营管理。因此，会计人员需要根据相关会计准则，对每一笔跨行交易进行恰当的分类和记账，确保会计信息的质量。

维持企业运营的流畅

跨行会计分录的正确处理，不仅关乎财务记录的准确性，也直接关系到企业日常运营的流畅性。如果因为跨行分录处理不当造成资金流转的延误或账务问题，可能会对企业的供应商付款、员工薪资发放等日常经营活动产生影响。因此，通过规范的跨行会计分录处理，能够保障企业资金运作的效率和安全性。

总之，跨行做会计分录是企业财务工作中的一项重要内容，它确保了企业跨行交易的准确性、资金流的透明性和企业经营的连续性。企业应当重视跨行会计分录的处理工作，并加强相关人员的培训，提高会计分录处理的效率和质量。