吕军于1982年04月至1984年09月在上虞县百官财税所工作，随后在1984年09月至1988年09月，他在上虞市财税局工作。

1988年9月至1991年1月，吕军担任上虞市财税局农财股副股长。紧接着，从1991年1月至1993年9月，他成为上虞市财税局农财股股长，并在1988年9月至1991年7月期间，他在浙江财经学院财经专业大专函授学习。

1993年9月至1994年4月，吕军担任上虞市财税局农财科科长。之后，他于1994年4月至1997年4月担任上虞市水利局党委委员、副局长，并在1993年9月至1996年7月期间，他在浙江财经学院投资经济管理专业大专函授学习。

1997年4月至1998年1月，吕军是上虞市小舜江工程办公室副主任。1998年1月至2000年1月，他担任上虞市小舜江工程办公室主任。2000年1月至2001年11月，他在上虞市人民政府办公室担任副主任。

2001年11月至2003年1月，吕军担任上虞市水利局党委书记、局长。2003年1月至2003年12月，他担任杭州湾精细化工园区党委书记、管委会主任，港务局党组书记，并于2003年7月成为杭州湾上虞新区党工委副书记、管委会主任。在2003年12月至2006年12月期间，吕军是上虞市人民政府副市长，杭州湾精细化工园区党委书记，港务局党组书记，杭州湾上虞新区党工委副书记、管委会主任，并于2004年2月成为市政府党组成员。2003年9月至2005年12月，他在省委党校经济管理专业本科函授学习。

2006年12月至2012年1月，吕军担任上虞市委委员，市人民政府党组成员、副市长，市港务局党组书记。自2012年1月至今，他一直担任上虞市委常委、市人民政府党组成员、副市长、港务管理局党组书记。

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  吕 军