广东科技大学的校区布局主要分为几个部分：广东科学技术职业学院主要负责本科教育，注重教学和实验实训；中科院研究生教育南方基地则专注于博士硕士生的培养。同时，广东计算中心、广东情报所和广东测试所作为实践教学基地和科技创新基地，侧重于科技创新活动。

在专业建设和本专科生培养方面，广东科技大学由研究生院、软体学院、资讯学院和继续教育学院四院组成，以及包括建工系、材料系等在内的十三个系，以及计算所、测试所等四所和多个研究中心和工程中心。学校以电脑资讯技术、材料与能源技术、生物和医药技术为主，设有约60个本专科专业，每年招生量可达5000名，预计在校生规模将达到25000人。

在科学研究与研究生培养方面，广东科技大学的研究所、研发中心和重点实验室致力于服务广东经济社会发展，同时承担国家、省市及企事业单位的科研任务，同时为在校大学生提供实习和实践机会，加强教学互动。

在管理运行机制上，广东科技大学由广东和中科院共建，实施灵活的管理模式。各并入的研究所、室和中心保持相对独立的人、财、物管理，以保持其特色和基础，同时推动与社会和企业的紧密合作，确保教育质量和自主性。