员工的奖金应计入工资薪金支出科目。

详细解释如下：

1. 奖金的概述：奖金是员工因工作表现优秀或达到特定目标而获得的额外报酬，是工资的重要组成部分。企业发放奖金的目的在于激励员工的工作积极性，提高工作效率。

2. 会计科目的选择：在会计上，企业支付的员工奖金应被记录在适当的科目中。由于奖金属于工资的一部分，因此应计入“工资薪金支出”科目。这一科目主要记录企业为获得员工服务而发生的所有相关支出，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等。

3. 税务处理：在税务处理上，员工的奖金与基本工资一样，都需要计入员工的个人所得税计税基数。企业发放奖金时，需代扣代缴员工的个人所得税。

综上所述，企业的员工奖金应计入“工资薪金支出”科目。这不仅符合会计准则的要求，也体现了奖金作为工资重要组成部分的实质。