数学与系统科学研究院

位于北京中关村东路55号。

物理研究所

坐落于北京市海淀区中关村南三街8号。

理论物理研究所

同为北京中关村东路55号。

理化技术研究所

设于北京市中关村北一条2号。

化学研究所

位于北京海淀中关村北一街2号。

过程工程研究所

在北京市海淀区中关村北二条1号。

空间科学与应用研究中心

设在北京中关村南二条1号。

微生物研究所

位于北京市海淀区中关村北一条13号。

计算技术研究所

坐落于北京中关村科学院南路6号。

工程热物理研究所

设于北京市海淀区中关村路乙12。

自动化研究所

位于北京市海淀区中关村东路95号。

电工研究所

在北京市海淀区中关村北二条6号。

北京市海淀区中关村南四街4号

文献情报中心设于北京中关村北四环西路33号。

科技政策与管理科学研究所

同在北京中关村东路55号。

光电研究院

位于北京市海淀区中关村东路95号自动化大厦4层。

国家纳米科学中心

设于北京海淀中关村北一街2号，位于中科院化学所院内。