南京中医药大学的针灸推拿专业在行业内颇有名气，不少医院甚至对针灸推拿专业的博士生有特别需求，工作强度相对较大。

中医学专业，尤其是中医学（七年制）、中西医结合、针灸推拿、国家理科基地班、中药学、中药药理、临床药学、食品与药品监测、药物制剂、中西医临床医学、针灸推拿学、药学、中药资源与开发等专业，都是南京中医药大学的优势学科。这些专业不仅在国内享有盛誉，部分还与国际接轨，为学生提供了广阔的学术与就业前景。

中医学（七年制）专业是南京中医药大学的重点培训基地，作为中医大学，中医学自然成为了其教学的核心。学生在学习过程中，不仅能深入理解中医理论，还能掌握实际操作技能，为将来从事中医领域的工作打下坚实基础。

在众多专业中，临床学专业被认为是南京中医药大学的亮点之一，为学生提供了将理论知识应用于临床实践的机会，培养了大量具备扎实医学知识和丰富临床经验的专业人才。