根据《民间非营利组织会计》规定：

4301提供服务收入

　　一、本科目核算民间非营利组织根据章程等的规定向其服务对象提供服务取得的收入，包括学杂费收入、医疗费收入、培训收入等。

　　一般情况下，民间非营利组织的提供服务收入为非限定性收入，除非相关资产提供者对资产的使用设置了限制。

因此，民办非企非盈利机构学费收入应当在”提供服务收入“科目核算。