全国最好的医科大学是：北京协和医学院。

北京协和医学院(Peking Union Medical College)是中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会直属的一所重点医科大学，与中国医学科学院院校一体，是中国国家级医学科学学术中心和综合性科学研究机构。"卓越医生教育培养计划"试点高校。北京协和医学院由美国洛克菲勒基金会于1917年捐资创办，1919年10月开办八年制医学本科，是我国最早设有八年制临床医学专业和护理本科教育的医学院校，被誉为中国医学殿堂。

学校历经"私立北平协和医学院"、"中国协和医学院"、"中国首都医科大学"、"中国协和医科大学"等多个历史阶段，于2007年5月18日正式复名为北京协和医学院。