教师职称中的员级与助理级在评审申报条件、学历起点、评审流程等方面存在明显差异，具体区别如下：

首先，两者在评审申报条件上有所不同。员级职称要求中等专业学校毕业生从事专业技术工作一年以上，或符合其他评定条件的人员；而助理级职称则对学历和工作年限有更高要求，如硕士研究生毕业可以直接评定，大学本科毕业生需从事专业技术工作一年以上，专科毕业生需三年以上，中专毕业生则需在取得员级职称后从事四年工作。

其次，学历起点也不尽相同。高中学历的教师需从员级职称开始申报，而本科及以上学历的教师则可以直接申报助理级职称。

再者，在评审流程上，员级与助理级也有所区别。教师通常需先通过员级评审，累积一定年限和经验后，才能继续申报晋升至助理级职称。

总之，教师职称中的员级与助理级在申报条件、学历起点、评审流程等方面均存在明显差异，这不仅反映了职称评定的层次性，也体现了对不同教育背景和工作经历教师的公正评价。通过这样的分级制度，能够更全面地衡量和认可教师的专业技能和贡献，促进教育行业的健康发展。