学校实行校长全面负责，党组织“保证监督”，教职工民主管理学校的管理体制。校长有决策权，分管副校长直接对校长负责，各处室、年级负责人直接向分管副校长负责，岗位责任明确，机构运行效率高。校长、党支部、教代会和民主党派关系融洽。学校重大改革举措和决策，校长均和支部反复研究，交教代会讨论，并充分征求民主党派和个人教职工意见，然后实施。学校管理工作得到党组织的有效监督和教职工大力支持。

详见《九十五中管理体制示意图》。