多样性指数是用来评估生物多样性的指标，常用于生态学和环境科学领域。计算多样性指数的方法有很多种，可以使用多种软件进行计算。以下是常用的几种软件及其特点：

1. R语言：R是一种免费的开源软件，具有强大的数据分析和统计功能。R语言中有许多用于计算多样性指数的包，如vegan、BiodiversityR等，可以对各种多样性指数进行计算和可视化。

2. PRIMER：PRIMER是一种商业化软件，主要用于海洋生态学和生物多样性领域的统计分析和可视化。PRIMER可以计算多种多样性指数，如Shannon指数、Simpson指数、Bray-Curtis相似性指数等。

3. PAST：PAST是一款免费的软件，主要用于生态学和生物多样性领域的数据分析和可视化。PAST可以计算多种多样性指数，如Shannon指数、Simpson指数、Jaccard相似性指数等。

4. Excel：Excel是一种常用的电子表格软件，也可以用于计算多样性指数。Excel中可以使用各种公式和函数，如SUM、LN、SQRT等，来计算各种多样性指数。

需要注意的是，计算多样性指数需要具备一定的生态学和统计学知识，并且需要根据具体问题选择合适的指数计算方法和软件。在使用软件进行计算时，也需要注意数据的准确性和合理性，避免出现误差和偏差。