首先最重要的一点事保证大分子物质不变性，否则分离纯化的工作将毫无意义，对于分离dna如果，是从生物体中直接提纯，要注意提取溶液的浓度，根据你所想要的A型或者B型来选配盐水，ph当然很重要，稍微偏碱性有利于提纯。如果从rna和dna的混合物种分离，直接使用弱碱性的缓冲液进行电泳就行。

此外，就是要提取周期短。周期越长提取效果越差

步骤尽量简洁。过于繁琐的步骤会让生物大分子活性降低，尤其提取酶的时候尤其重要

当然一定的纯度也是必须的考虑因素，根据实验需要，提纯也需要不同的纯度，自然方法有差异

提纯过程中的副产物也是需要考虑的因素。要保证他们不能影响提纯工作的进行