两者的区别是收录内容不同、语言使用不同。

1、收录内容不同：香港宝典主要收录了香港地区的经典文献和古籍，而澳门宝典则主要收录了澳门地区的经典文献和古籍。因此，两部宝典的内容涉及到的文献和古籍是不同的。

2、语言使用不同：香港宝典使用的语言主要是广东话和中文，而澳门宝典使用的语言主要是葡萄牙语和中文。这是因为香港和澳门的语言使用习惯不同，因此，两部宝典的语言也有所区别。