适用民间非营利组织会计制度的民间非营利组织应当同时具备以下特征：

（一）、该组织不以营利为宗旨和目的；

（二）、资源提供者向该组织投入资源不取得经济回报；

（三）、资源提供者不享有该组织的所有权。

如果你的医院符合上述三个条件，则执行民间非营利组织会计制度并按该制度进行会计核算：

可以采用先进先出法、加权平均法、移动平均法、个别计价法或后进先出法确定其实际成本

借：业务活动成本

贷：库存药品

期末将业务活动成本结转到净资产项下的非限定性净资产

借：净资产-非限定性净资产

贷：业务活动成本

如果你的医院不同是符合上述三个条件，就应执行企业会计制度，按企业会计制度的规定进行会计核算：

仍可采用先进先出法、加权平均法、移动平均法、个别计价法或后进先出法确定其实际成本

借：主营业务成本

贷：库存药品

期末将主营业务成本结转到本年利润

借：本年利润

贷：主营业务成本