在劳动合同法的保护下，农民工权益得到保障。首要的是提高自身素质，深入理解法律，灵活运用法律武器维护自身权益。

依法签订劳动合同，是维护权益的第一步。入职前，务必签订合同，明确工作内容、地点、条件和劳动报酬等条款。劳动者应享有知情权，合同中应详细说明工作情况，避免出现意外情况。签订合同时，务必审查合同内容，确保自身权益得到保障。

劳动者有权抵制违章指挥。在工作中遇到不安全或违法的指挥时，应坚决抵制，必要时可拒绝执行。保护自身安全，维护劳动权益。

劳动者有权单方解除合同。当工作条件、环境、待遇等无法满足自身需求，或遇到无法解决的问题时，有权提前解除合同。解除合同时，应按法律规定进行，避免造成不必要的损失。

《劳动法》第五十条明确规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或无故拖欠。确保工资按时足额发放，是企业应尽的责任，也是法律对劳动者的基本保障。

综上所述，通过提高自身素质、依法签订合同、行使合法权益、维护自身安全以及确保工资及时发放，农民工可以有效地保护自己的权益。在工作中遇到问题时，应积极运用法律手段，维护自身合法权益，实现公平、公正的劳动环境。