根据软科中国大学排名，南方科技大学在全国大学中排名第46位，虽然低于上海大学，但高于南京农业大学。在校友会中国理工类大学排名中，南科大位列第47位，虽然低于长安大学，但也略高于天津工业大学。尽管南科大在综合排名上未能跻身前茅，但作为一所成立不到十年的大学，其在各类榜单上的表现已经非常出色，甚至超越了许多老牌211高校。

南方科技大学依托深圳市的大力支持，拥有强大的师资力量和丰富的教学资源。学校目前签约引进教师1101人，其中包括45位院士。90%以上的教学科研系列教师拥有海外工作经验，其中60%以上曾在世界排名前100的大学工作或学习，高级人才占比超过40%。尽管在办学资源上与清华、北大等顶尖高校相比还有一定差距，但考虑到南科大的办学理念，其在教育领域的水平依然处于全国前列，甚至与一些985高校相比也不逊色。

作为深圳在中国高等教育改革发展的背景下创建的一所高起点、高定位的公办创新型大学，南方科技大学得到了政府的强力支持。深圳政府不仅提供大量教育经费，还在2018年以来将两个最好的三甲医院划拨为该校的直属附属医院，共建了南科大盐田医院等四所医院，并批建南科大总医院，有力支撑该校的医学发展。此外，南科大也是我国少数几所建校历史短却拥有博士点和硕士点的高等院校。

南科大以其“学分制、书院制、导师制”和“国际化、个性化、精英化”为核心特色，致力于培养拔尖创新人才。学校坚持国际化办学，除少数课程外，基本使用英文原版教材，采用中英双语或全英文授课，是我国目前国际化程度最高的国内公办大学之一。这种办学理念不仅吸引了大量海外优秀人才，也为学生提供了与国际接轨的学习环境。