准备身份证明、结婚证明、居住证明等基本材料，并根据实际情况可能需要提供分居协议、子女出生证明等其他相关材料。

一、身份证明

首先，夫妻双方都需要提供有效的身份证明，如身份证或护照。这是确认申请人和其配偶身份的基本材料，也是办理分居证明的必备条件。

二、结婚证明

结婚证是证明夫妻双方婚姻关系的法律文件。在申请分居证明时，需要提交结婚证的原件或复印件，以证明申请人与配偶之间的婚姻关系。

三、居住证明

居住证明是用于证明夫妻双方分开居住的材料。这可以是租房合同、房屋产权证明、水电费账单等，用于证明双方在不同地址居住的情况。如果是自有住房，可以提供房产证和居住地址的相关证明。

四、分居协议（如有）

如果夫妻双方已经签订了分居协议，那么该协议也应作为申请材料之一。分居协议是双方自愿达成的，详细规定了分居期间的各项事务，如财产分割、子女抚养等。

五、其他相关材料

根据具体情况，可能还需要提供其他相关材料，如子女的出生证明、财产清单等。这些材料有助于更全面地了解夫妻双方的实际情况，为办理分居证明提供更有力的依据。

在准备好上述材料后，申请人可以前往当地民政局或婚姻登记机构提交申请。机构会对提交的材料进行审核，核实夫妻双方的身份、婚姻关系和居住情况。如果材料齐全且符合要求，机构会出具分居证明。

综上所述：

申请分居证明需要准备身份证明、结婚证明、居住证明等基本材料，并根据实际情况可能需要提供分居协议、子女出生证明等其他相关材料。申请人需要前往当地民政局或婚姻登记机构提交申请，并经过审核后才能获得分居证明。

法律依据：

《中华人民共和国婚姻法》

第三十二条规定：

男女一方要求离婚的，可由有关部门进行调解或直接向人民法院提出离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如感情确已破裂，调解无效，应准予离婚。请的顺利进行。