各大学临床医学专业在各学年度安排的课程并不一致，大二期间开设的课程开始涉及更深层次的医学课程。上学期开设的专业课程一般有：生物化学、机能实验学1、系统解剖学、医学遗传学、组织胚胎学等；下学期开设的专业课程一般有：细胞生物学、微生物与免疫学、生理学、人体寄生虫学、局部解剖学、机能实验学2等。