加利福尼亚最初是墨西哥国土的一部分（是的，美国西部很大一部分土地以前都属于墨西哥）。美军上尉John C. Frémont散布谣言反对由墨西哥政府安排的移居者和鼓励居民叛乱。一队33人小组步入Sonoma市中心，升上一面熊和星的国旗(熊旗子) 象征新的加利福尼亚共和国(California Republic)诞生，独立于墨西哥。

当时这个加利福尼亚共和国的国土大约是这样的：

1846年5月13日，美国向墨西哥宣战，但消息直到7月中旬才到达加利福尼亚。在1846年7月7日，John D. Sloat领导的美国海军和驻防在Monterey口岸的墨西哥海岸警卫队有较小的冲突，John C. Frémont警觉美墨战争开始了，摒弃了独立的想法加入了美国。

加利福尼亚共和国在历史上存在时间很短，从1846年6月独立到7月加入美国，中间只存在了不到2个月。但加利福尼亚共和国代表了加州的一段历史，因此在州旗上有所保留。于是这就是我们今天看到的加州州旗：