正式会员分为两种：国际科学联合成员及国家会员。

国际科学联合成员(Scientific Union)

必须为国际性的非政府专业组织，而且在某一科学领域内已存在 6 年以上才符合资格。

国际数学联合会，国际天文联合会，国际纯粹与应用化学联合会 等都属此类成员。

国家会员(National Member)

必须为科学院、研究院、研究理事会、科学机构、学术团体、科学学会或协会等的国家级学术组织。而且至许须存在4年以上，在特定国家或地区内能构代表某一科学领域的学术团体才符合资格。

来自各个国家的科学家也可以成立科学机构(学院、研究理事会等)申请作为国家会员，或是透过国家会员(每个国家不超过 1 个)参加或依附于国际科学联合会而成为附属成员。

联系会员(Affiliated Member)

联系会员是指有资格，但是尚未完全准备成为正式会员的学术机构。联系会员有义务支持国际科学联合会宗旨，坚持科学普遍性的原则，同时承担财务方面的责任。

联系会员之中又分为三种：国家会员、国际科学联合会成员及区域性学术团体。 必须为有潜力及资格的科学院、研究院、研究理事会、科学机构、学术团体、科学学会或协会等的国家级学术组织。必须为科学院、研究院、研究理事会、科学机构、学术团体、科学学会或其他的学术组织。通常国家联系会员在 6 年之後可申请成为正式会员。

国际科学联系成员

指研究领域不属于国际科学联合会的范围，但是为相关研究领域(例如人类学、医学、社会学等)的科学组织，这类组织至少须存在 6 年。此类的会员并没有投票权。

区域性联系成员

来自各个国家的科学家成立的科学组织(科学院、研究理事会等)，其研究领域不属于国际科学联合会的范围，但是为相关研究领域。此类的会员并没有投票权。

观察员 (Observer)

假如会员无法承担财务方面的责任，则只能成为观察员。通常观察员的身份将保留不超过 6 年。观察员应该立即检讨或改正，重新申请为会员。

到2002年9月底，国际科学理事会有 101 个国家会员(包括 73 个正式会员，15 个附属成员及 13 个观察员)，27 个国际科学联合成员，26 个国际科学联系成员和 4 个区域性联系成员。