东北大学秦皇岛分校与本校的区别体现在多个方面。东北大学秦皇岛分校实际上就是东北大学的一个校区，隶属于东北大学。东北大学本部则是东北大学的主校区，行政级别上通常比分校要高。在代码识别上，东北大学本部被标记为10145，而秦皇岛分校则为19145。

录取分数线方面，东北大学秦皇岛分校的分数线通常比东北大学本部要低一些。在保研率上，东北大学的本部约为18%，而秦皇岛分校则为5%，总体保研率大约在15%左右。科研能力与研究生招生方面，东北大学本部通常拥有更高的水平与更丰富的资源，如科研数据与研究生招生等。

在学术水平上，东北大学被列为985工程高校，而东北大学秦皇岛分校则在各方面水平上可能低于211工程高校的平均水平。特别是保研率方面，秦皇岛分校的保研率显著低于一般的211工程高校。

综上所述，东北大学本部与秦皇岛分校在行政地位、录取分数线、保研率、科研能力以及学术水平上存在明显差异。东北大学本部作为主校区，拥有更高的行政地位、更严格的录取要求、更高的保研率、更优秀的科研水平和更丰富的研究生教育资源。而东北大学秦皇岛分校则在这些方面有所不足，特别是在保研率和学术水平上，可能低于东北大学本部和其他211工程高校。