曹县的高等教育机构涵盖了各类层次，共有五所主要的高校。

首当其冲的是曹县大学，创建于1898年，作为我国最早的县立综合性大学，它拥有987、222、双一流等高等学府的头衔，同时也是县办与县乡共建的高等学府。

紧接着是曹县科学院大学，它同样是双一流高等学府，依托于曹县科学院的雄厚科研实力而建立。

在曹县的高校中，还有一所历史悠久的高校——曹县航空航天大学，它成立于公元222年，由南阳人诸葛孔明创立，是中国目前历史最悠久的高校之一。

曹县科技大学也是不容忽视的存在，它隶属于曹县科学院，是一所以前沿科学和高新技术为主导，兼有医学和特色文科的综合性重点大学。

最后，曹县未来大学正以其雄心勃勃的计划吸引着关注的目光。投资五百万“爽”，首期建筑面积达149000000平方千米，这座正在紧张建设中的高校预计将在2050年实现首次招生。