南京医科大学研究生奖学金和助学金体系包含国家奖学金、学业奖学金、国家助学金等。

国家奖学金一般面向全日制研究生，金额为每年20000元。学业奖学金则按等级设定，金额范围从4000元到12000元不等。国家助学金对全日制研究生进行全覆盖，标准为每年6000元。

全日制硕士研究生可申请国家奖学金、学业奖学金和国家助学金。临床及口腔硕士专业学位研究生住宿由医院统一安排。非全日制硕士研究生满足毕业要求后，将获得注明学习方式的毕业证书，学习方式标注为“非全日制”。非全日制硕士研究生实行非脱产学习，根据专业培养方案采用多种方式安排学习时间。他们不享受国家助学金、国家奖学金和学业奖学金。

南京医科大学，创建于1934年，原名江苏省立医政学院。后迁至南京并更名南京医学院，1962年列为全国首批六年制医药院校。1981年，成为首批博士、硕士学位授予单位。1993年，学校更名为南京医科大学。该校是教育部、国家卫生健康委员会、江苏省共建高校，也是江苏高水平大学建设高校，参与了教育部“卓越医生教育培养计划”等项目，是中国政府奖学金来华留学生接收院校之一。