日本东京大学在多个专业领域表现突出。根据2015年QS世界大学排名，东京大学的会计与金融、化学、计算机科学与信息系统、发展研究、地球与海洋科学、经济学与计量经济学、化学工程、土木工程、电气与电子工程、工程机械、航空和制造、英语语言文学、环境科学、地理学、历史学、法律、语言学、材料科学、数学、医学、药学与药理学、哲学、物理与天文学、政治与国际研究、社会学、统计与运筹学等领域均位列世界前50名。这些专业的排名显示了东京大学在科学研究和教育上的实力。

东京大学设有10个学部和12个研究科。其中，农学部开设了农业生物学、农业化学、林业学、水产学、农业经济学、农业工程、兽医学、林产学8系，附设有农场、实习林场、牧场、兽医院、水产实验场、绿地植物实验场等实习实验设施。工学部是东京大学最庞大的学部，涵盖了土木、机械、电子、船舶、航空、原子能、资源、金属、材料、应用化学、应用物理、计算等众多工程学科，还设有工程基础系和原子能工程研究综合试验场。经济学部仅设经济学、经营学两系，附属有日本产业经济研究室。

东京大学的理学部设数学、信息科学、物理、天文、地球物理、化学、生物化学、生物科学、地学9系，附属部门包括临海实验场、植物园、基本粒子物理国际中心、光谱化学研究中心、地壳化学研究室、天文学教学研究中心。法学部为东京大学历史最悠久、声望很高的学部，设有民主、公法、政治学3系，附属部门有外国法文献中心、近代日本法政史资料中心。文学部设文学、史学、语言学、行动学4系，附设文化交流、北海文化研究两实习实验部门，该学部亦出过众多名扬日本的文学家、诗人、俳名作家、艺人等明星。教育学部设教育学、教育心理学、学校教育、教育行政、体育和健康教育5系，附属学校有中学、高中各一所。

医学部则有医学、健康护理学两系，附设脑研究实验室、医学电子实验室、声音语言医学实验室、实验动物饲养室，两所附属医院，附属学校有养护学校、接生护士学校。东京大学的医学部以外科，特别是脑外科在世界上享有盛名。

东京大学作为日本顶尖学府，其各学部和研究科的专业设置广泛且均衡，为学生提供了多样化的学习机会。东京大学不仅在理工科领域具有优势，社会科学和人文学科同样出色，为培养未来的政治家、学者、艺术家等各方面人才提供了坚实的基础。