香港中文大学深圳校区和本部的区别主要体现在以下几个方面：

第一，学校性质的差异。深圳校区是根据中华人民共和国教育部批准，依据《中外合作办学条例》建立的一所大学，秉承了香港中文大学的办学理念和学术体系。而本部则是一所享有国际声誉的亚洲顶尖公立研究型综合大学。

第二，创办时间的不同。深圳校区成立于2014年4月，相比之下，本部创建于1963年10月。

深圳校区的专业设置包括国际商务、经济学、金融工程、市场营销、会计学、统计学、数学与应用数学、新能源科学与工程、计算机科学与技术等。而本部的专业领域则广泛，涵盖了人类学、中国语言及文学、英文、艺术、历史、哲学、宗教研究、神学、翻译、工商管理、环球商业学、健康与体育运动科学、生物医学工程学、计算机工程学、电子工程学、数学与信息工程学、法学、内外全科医学、公共卫生等。