目前多数省份实行二、三本合并政策，因此传统意义上的二本大学学费并不算高，而三本大学费用通常在二本的三到五倍区间。

公立二本院校的学费与一本批次院校相近，多数在每年4000到7000元之间，极少数专业每年学费可能低至4000元以下。普通专业学费超过7000元的并不多。相比之下，艺术类或中外合作办学、校企合作办学等特殊类型专业收费普遍超过1万元/年，部分专业甚至达到3至4万元/年，但这些专业的录取分数线通常低于本校普通类专业。目前，许多省份将三本合并到了二本批次，但原三本高校的办学性质和收费标准并未改变。这些老三本高校的学费多数在每年1.2万元到2万元之间，相当于公立本科普通类专业的三到五倍。同时，学费在2万元到5万元之间的民办院校、专业也较为常见，最贵的民办高校收费标准甚至达到每年十几万元。