这主要是与G-菌的细胞壁结构有关。其细胞壁由外到内依次是脂多糖（LPS）、外膜、脂蛋白、肽聚糖、周质空间（又称壁膜间隙，一般指其外膜与细胞膜之间的狭窄空间，呈胶状，肽聚糖薄膜层夹在其中）。

其中阻拦外界有害物质的进入主要是靠外膜。外膜是革兰氏阴性菌的一层保护性屏障，可阻止或减缓胆汁酸、抗体及其他有害物质的进入，也可以防止周质酶和细胞成分的外流。脂多糖(LPS）是位于G-菌细胞壁最外层的一层较厚的类脂多糖类物质，由类脂A、核心多糖和O-特异侧链三部分组成。其主要功能为：1、其中的类脂A是G-菌致病物质——内毒素的物质基础；2、其负电荷较强，与磷酸壁相似，也都吸附Mg+、Ca2+等阳离子以提高其在细胞表面的浓度作用；3、由于LPS结构的多变，决定了G-菌表面抗原决定簇；4、许多噬菌体在细胞表面的吸附受体；5、具有控制某些物质进出细胞的部分选择性屏障功能，例如它可以透过水、气体和若干较小的分子（嘌呤、嘧啶、双糖、肽类和氨基酸等），但能阻拦溶菌酶、抗生素（青霉素等），去污剂和某些染料等较大分子进入细胞膜。