DNA聚合酶实验室常用的耐热DNA聚合酶
耐热DNA聚合酶在PCR技术中广泛应用,根据其特性可大致分为三类:
第一类是普通耐热DNA聚合酶,如Taq DNA聚合酶,源自yT1水生栖热菌,具有5'-3'外切酶活性,但无3'-5'外切酶活性,因此在合成过程中对单核苷酸错配没有校正功能。这一酶在合成中还能将PCR双链产物的每一条链3'加入单核苷酸尾,使得PCR产物具有3'突出的单A核苷酸尾。此外,当仅存在dTTP时,它可以将平端的质粒的3'端加入单T核苷酸尾,从而实现PCR产物的T-A克隆法。Tth DNA聚合酶,来自Thermus thermophilus HB8,具有非模板依赖性活性,在高温及MnCl2条件下能有效逆转录RNA;添加Mg2+后,聚合活性显著提升,可实现cDNA合成与扩增。
第二类是高保真DNA聚合酶,如pfu DNA聚合酶和Vent DNA聚合酶。pfu DNA聚合酶来自Pyrococcus furiosis,无5'-3'外切酶活性,但具有3'-5'外切酶活性,用于校正PCR扩增过程中产生的错误,使产物的碱基错配率极低。Vent DNA聚合酶来自Litoralis栖热球菌,同样无5'-3'外切酶活性,但具有3'-5'外切酶活性,可去除错配的碱基,具备校对功能。
第三类是专门应用于DNA序列测定的耐热DNA聚合酶,如Promega公司的测序级TaqDNA聚合酶,通过去除5'-3'外切酶活性,确保测序结果的高度准确性,能产生强度均一的测序条带,背景清晰。Bca Best DNA聚合酶来自Bacillus Caldotenax YT-G菌株,其5'-3'外切酶活性缺失,具有卓越的伸长性能,能抑制DNA二级结构形成,从而获得均一的DNA测序带。Sac DNA聚合酶,来源于酸热浴流化裂片菌,无3'-5'外切酶活性,适用于DNA测序,但测序反应中ddNTP/dNTP的比率需较高。
扩展资料
DNA聚合酶(DNA polymerase)是细胞复制DNA的重要作用酶。DNA聚合酶 , 以DNA为复制模板,从将DNA由5'端点开始复制到3'端的酶。DNA聚合酶的主要活性是催化DNA的合成(在具备模板、引物、dNTP等的情况下)及其相辅的活性。
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