一、性质不同

1、保险单：保险人与投保人签订保险合同的书面证明。

2、保险凭证：指保险合同生效成立的证明文件，即简化的保险单。

二、内容特点不同

1、保险单：双方对有关保险标的事项的说明，包括被保险人名称，保险标的的名称及其存放地点或所处状态、保险金额、保险期限、保险费等；双方对有关保险标的事项的说明，包括被保险人名称，保险标的的名称及其存放地点或所处状态、保险金额、保险期限、保险费等。

2、保险凭证：保险凭证上通常不列明保险合同条款，与保险单具有同等效力。

三、作用不同

1、保险单：保险公司在保险单中就上述事项的说明有几种不同的表述，虽然字词相差不大，但对保险单会产生不同的法律效力，继而影响保险公司是否应该承担赔偿责任。

2、保险凭证：在一张团体保险单项下，需要给每一个参加保险的人签发一张单独的凭证；在货物运输保险订有预约合同的条件下，需要对每一笔货运签发单独的凭证。

参考资料来源：

百度百科-保险单

百度百科-保险凭证