龙岩市气象局的内设机构及其主要职能如下：

办公室（财务核算中心）：负责协调机关工作，管理后勤保障，处理政务信息、目标管理、文秘、机要、保密、宣传、档案、办公自动化、文印、收发等工作。负责本市气象行业规划计划项目的管理，预算、决算、项目建设、国库集中支付、政府采购和国有资产、统计等工作。指导全市气象部门各类资金管理。

业务科技科（人工影响天气办公室）：负责气象综合观测、气象预报预测工作、人工影响天气工作、信息网络和技术装备保障等业务管理工作。负责制订本行政区域内监测网络业务的发展规划和计划，组织实施全市性监测网络业务、预报业务现代化建设。负责气象台站探测环境保护的技术把关工作，信息共享管理，灾害性天气联防，突发气象灾害应急管理，气候资源开发利用与保护，生态与农业气象的规划实施，组织实施全市性现代化建设。组织科技成果及新技术、新业务的推广。龙岩市人工影响天气管理办公室挂靠该科。

政策法规科（防雷办公室）：负责行政法规管理、行业管理、标准化管理工作。组织草拟地方性气象法规、政策规章及规范性文件，组织协调和管理气象行政执法，承担气象行政复议、应诉、处罚听证、相关气象行政许可等工作。组织学习、宣传、普及法律法规，负责气象行业管理的综合协调，科技服务的宏观协调和政策指导，组织管理雷电灾害的防御工作。

人事教育科（监察审计科、精神文明建设办公室）：负责市局管理干部的考核、任免和后备干部队伍建设，全市气象系统机构编制、劳动工资、社会保障、录用调配、奖励、专业技术人员、聘用合同人事档案等各项人事管理工作。拟定人才培养规划、计划并组织实施，负责职工在职教育、培训的组织管理。负责本行政区域气象系统的党风廉政建设、监察、审计工作，对市局党组成员及党组管理干部实施党章和有关规定范围内的监督，负责局党组管理干部违纪案件和本行政区气象系统重大违纪案件的查处等工作。承担直属机关党委和精神文明建设方面的日常工作，归口管理工会、共青团、妇女、统战、侨务工作。协助地方党委和人民政府做好气象部门的精神文明建设和思想政治工作。负责全市气象系统离退休干部工作的宏观指导，承担市气象局机关离退休干部的管理及服务等工作。