莒南县烟草专卖局内设机构包含多个部门，各司其职，确保局（分公司）的高效运作和战略目标的实现。首先，办公室负责文秘档案、政策法规、内外协调沟通、会务管理、安全车辆管理、行政后勤与政务督察，为局（分公司）提供全面的行政支持和监督。

综合科则聚焦于营销管理、绩效目标管理等，确保战略目标的实现，同时进行投资、价格、信息化和多元产业的管理工作，以及计划统计与经济运行分析，促进节能减排。

专卖监督管理科是市场监管的核心部门，负责卷烟市场管理、查处违法案件，对内部卷烟经营活动进行监督，为年度计划提供有力保障。

在财务方面，财务审计科依据国家财税法规，进行财务监督、预算管理和内部审计，确保企业财务管理的规范性。

客户服务部主要负责卷烟销售、配送和客户关系管理，确保销售目标的达成，同时推动网络建设和品类管理。

而政工科则负责人力资源管理、教育培训、党务工作等，致力于提升队伍素质，维护内部和谐稳定。

最后，基层稽查中队（区域客户服务部）在上级领导下，负责落实辖区内的专销管理和经营战略，保证目标的实现。