上海中医药大学重点学科涵盖多个领域，包括中医学、中药学、中医外科学、中医内科学、中医骨伤科学、中医医史文献学、针灸推拿学、药用植物学、中医诊断学、中医药工程学等。学校在第二轮“双一流”建设中，中医学与中药学被列为建设学科。国家重点学科包括中医外科学、中药学、中医内科学与中医骨伤科学。国家重点（培育）学科则有中医医史文献学与针灸推拿学。国家中医药管理局重点学科多达38个，覆盖药用植物学、中医诊断学、中医各家学说、中医药工程学等众多领域。学校在高峰高原学科中，中药学与中医学被评为I类高峰，中西医结合为I类高峰，科学技术史为I类高原。在一流学科中，中药学与中医学被评为A类，中西医结合、科学技术史、药学与护理学为B类。

上海中医药大学创建于1956年，是中国成立最早的中医药高等院校之一。学校位于上海市，由教育部与上海市人民政府共建。作为上海市重点建设的高水平大学，上海中医药大学同时也是国家“双一流”建设高校、世界一流中医药大学建设联盟与长三角医学教育联盟的创始成员。学校与上海市中医药研究院合署运行，是中国政府奖学金来华留学生接收院校，也是上海市首批深化创新创业教育改革示范高校。

在全国第四轮学科评估中，上海中医药大学的中医学、中西医结合与中药学三个一级学科均被评为A+，在全国同类院校中独占鳌头。学校在中医药领域的卓越成就与高水平教育建设，为培养具有国际竞争力的中医药人才奠定了坚实基础。