南京大学的匡亚明学院起源于南京大学少年部，自2006年4月为纪念匡亚明老校长诞辰100周年而更名，成为南京大学教育改革和杰出人才培养的重要试点单位。匡亚明学院致力于培养具有良好科学精神、人文素养、宽厚学科基础、突出创新能力的拔尖人才。

而浙江大学的竺可桢学院则创建于2000年5月，是以浙江大学老校长竺可桢的名字命名的荣誉学院。其前身是1984年创立的浙江大学（工科）混合班。现任院长为浙江大学校长吴朝晖。

竺可桢学院以“培养为杰出人才的成长奠定坚实的基础”为宗旨，旨在培养“基础宽厚、知识、能力、素质协调发展，富有创新精神和能力的卓越人才”。学院通过独特的培养方案和丰富的学术活动，为学生提供个性化的教育。

两个学院各有特色，南京大学的匡亚明学院注重科学精神与人文素养的结合，而浙江大学的竺可桢学院则更强调基础学科的扎实培养和创新能力的提升。具体选择哪个学院，取决于个人的兴趣和未来的职业规划。

南京大学匡亚明学院与浙江大学竺可桢学院在教学理念、培养目标和学生资源方面均有所不同。匡亚明学院可能更加注重人文与科学的融合，而竺可桢学院则可能更侧重于理工科的扎实基础和创新思维的培养。

无论选择哪个学院，学生都将有机会接受高质量的教育，并在学术和实践中不断提升自我。最终的选择应该基于个人的兴趣、职业目标以及对不同学院特色和资源的了解。