分子：组成物质化学性质的最小微粒。

元素：是具有相同核电荷数（质子数）的同一类原子的总称。

分子是由原子组成的。分子，原子十九物质的围观状态来说的，元素是就物质的宏观状态来分析的。

比如臭氧跟氧气：保持臭氧化学性质的最小微粒是臭氧分子O3，而不是氧原子。同样保持氧气化学性质的最小微粒是氧气分子O2。氧原子决定不了物质，因为它可以不同的数目结合成不同的分子。稀有气体是单原子分子，所以其性质可由原子决定。

元素只能说某种物质是由什么什么元素组成的，元素没有数量的区分。