中本贯通项目的毕业证书与通过高考考入本科的毕业证书在形式和内容上存在差异。中本贯通项目，即中等职业教育与应用本科教育的衔接，其培养目标在于为社会生产、建设、管理、服务等领域输送高素质的技术应用型人才。与此相比，通过高考考入的本科项目则侧重于培养学生的学科知识、学术研究能力以及综合素质。因此，两者的培养方向和目标大相径庭。

在培训方式上，中本贯通项目注重学生技术应用能力的培养，而高考考入的本科项目则更加重视学生的综合能力和素质的全面提升。这也意味着，中本贯通项目的学生在技能实践方面将会有更深入的积累。

关于文凭的具体情况，根据官方文件的规定，完成中本贯通项目本科阶段教学计划并满足毕业条件的学生，将获得本科学院的毕业证书。但是，与高考考入本科的学生相比，中本贯通项目的学生在毕业后可能仅有毕业证书，而没有学位证书。高考考入本科的学生在完成学业后，通常会同时获得毕业证书和学位证书。

总结来说，中本贯通项目的毕业证书与高考考入本科的毕业证书在类型和内涵上有所区别，这反映了两者在教育目标、培养模式以及学生发展前景上的不同。