在"I'm afraid it was too late"这个句子中，主句用的是现在完成时态，其中的"am"是现在时态的"be"动词，"afraid"是形容词，"it"是代词作主语，"was"是过去时态的"be"动词，"too late"是表示时间的短语。

而在这个句子中，"it was too late"是一个从句，其时态用的是过去时态，表示在过去某个时间点或某个事件发生时，事情已经晚了。两个句子所用的时态不同是因为它们分别描述了不同的时间点或事件。