单细胞生物的结构层次是细胞。单细胞生物由单个细胞直接构成个体，不具组织、器官、系统这三个结构层次。具有一般细胞的基本结构，如细胞膜、细胞质和细胞核，但也有其本身的特殊结构，如纤毛等。