三个。根据查询清华大学附属中学官网得知，清华大学附属中学拥有三个校区，分别为本部位于北京市海淀区中关村北大街，将台路校区位于北京市朝阳区将台路，奥森校区位于北京市朝阳区林萃路国家网球中心。