复旦IC卡与普通IC卡的应用范围不同，前者主要针对学生、教工等校内人员使用，后者则适用于银行、交通、社保等不同领域。

功能特点上，复旦IC卡除了存储与读取功能外，还具备校园特色应用，如门禁、图书馆借阅等，而普通IC卡则更多聚焦于支付、身份认证。

在安全性方面，复旦IC卡采用高级密码技术和加密算法，确保用户信息和资产安全，而普通IC卡因使用场景广泛，可能面临更高的安全风险。

复旦IC卡由学校或单位发放并管理，避免个人信息泄露，而普通IC卡由银行或政府机构发放，个人需自行管理。

兼容性方面，复旦IC卡仅限于复旦校园内使用，而普通IC卡具有广泛兼容性，可在不同地方使用。