你好，如果是在厦门大学和中国科学技术大学（该大学一般不称呼为中国科技大学，要简称就叫中科大，要么就全称）中选择，综合各方面来说都是中科大更好，中科大很低调，但是从科研水平角度来讲，在国内不比清华北大差，是科学家的摇篮，并且中科大的学风是相当好的。厦大无论是从声誉还是从实力来讲，是比不过中科大的。

　　不过自动化属于工科类专业，其实中科大也不是很擅长，术业有专攻，自动化建议考虑上海交大，或者哈尔滨工业大学，西安交通大学，天津大学等工科实力突出的大学。