扬州大学医学院创建于1950年，拥有五个本科专业，包括临床医学、中医学、中西医临床医学、护理学和药学。其中临床医学、中医学和中西医临床医学专业设有5年学制，护理学和药学专业为4年制。特色专业如临床医学妇产科学与皮肤性病防治在省内外享有较高的声誉。学院具备接收英语授课的本科临床医学留学生资格，自2006年起招生，采用全英文教学。学院拥有中西医结合一级学科博士学位点，以及基础医学、临床医学等六个一级学科硕士学位点和临床医学、中药学等专业硕士学位点，其中中西医结合临床医学为省级重点学科，消化内科等九个科室是省级重点临床专科，并设有国家级培训中心和基地。

学院设有基础医学部、五个临床系和护理学、药学系，拥有多个省级实验教学中心和临床实习基地，如江苏省苏北人民医院、扬州市第一人民医院等。学院在科研方面成果丰硕，承担多项国家级和省部级项目，对社会和经济产生积极影响。学院的《实用临床医药杂志》是全国核心学术期刊，多次荣获教育部奖项。

师资队伍强大，共有155名专任教师，其中94人具备副高及以上职称，教授和副教授占比高，具有博士学位的教师28人，硕士学位52人。学院还拥有博士生导师和硕士生导师，以及省内外优秀人才和劳模等。

临床教学是医学院的基石，与40多家医院建立了紧密的合作关系，包括扬州苏北人民医院、扬州市第一人民医院等，这些医院既是临床医学院也是教学医院。