十六大与十六届三中全会是不同性质的会议，十六大是代表大会，十六届三中全会是中央委员会的会议。

十六大，全称为第十六次代表大会，主要由全体代表参与，通常涉及政治决策、政策制定、选举重要领导人等重大事项。

十六届三中全会，则是第十六届第三次中央委员会全体会议，参与者是中央委员会成员，其议程通常围绕中央委员会的决策、政策审议、政治路线制定等高级别政治议题展开。

在组织形式上，十六大更多地侧重于广泛的政治参与和决策民主化，而十六届三中全会则更加聚焦于中央层面的决策与政策指导，体现中央集体智慧的集中体现。

十六大与十六届三中全会的区别还体现在其功能和目标上。十六大主要关注的是对国家发展方向、政治制度、经济政策等宏观层面的指导与规划，是国家政治生活的重要组成部分。而十六届三中全会则侧重于对中央政策的审议、决策，以及对中央委员会工作进行总结与部署，是中央内部决策与管理的重要平台。

综上所述，十六大与十六届三中全会虽然都属于高层政治会议，但在会议性质、参与者、议程内容、功能目标等方面存在显著区别，分别服务于不同层次的政治决策与管理工作。