职能和级别不同。根据查询天天高考网显示。

1、担任学校总支书记兼副校长可以在参与总支书记职责的同时还能参与学校管理工作，而只担任总支书记就不方便参与学校管理工作。

2、担任学校总支书记兼副校长有行政管理职责，名义上和正校长同级，而在没有行政管理职责的情况下，党总支记的权力和作用明显不如校长。